Расставим знаки препинания:
В четком строю,(1) то выныривая,(2) то пропадая,(3) дельфины промелькнули по левому борту,(4) и мне показалось, (5) что они бегут, (6) будто спасаясь от чего-то.

1), 2), 3) запятые выделяют одиночные деепричастия; запятая под номером 2) ещё и между однородными обстоятельствами, выраженными деепричастиями.
4)  запятая между основами, соединёнными сочинительным союзом И.
5)  запятая выделяет придаточное предложение.
6)  запятая выделяет сравнительный оборот, выраженный деепричастным оборотом.

Ответ: 123456.