Имя существительное «башня» 1 склонения, женского рода. Из-за того, что оно оканчивается на «ня», часто возникает вопрос: как верно, несколько башней или несколько башен_, то есть с окончанием «ей» или нулевым. Если обратиться к простым словам 1 склонения ж. рода (типа книга, земля, ручка) и поставить их в родительный падеж мн. числа (книг_, земель_, ручек_), то можно убедиться, что для них характерно нулевое окончание. Следовательно, и слово «башня» также должно быть с нулевым окончанием: башен_.
Вторая сложность заключается в написании мягкого знака в конце слова, нужен он или нет. Тут необходимо вспомнить правило: Ь после «н» в родительном падеже мн. числа не пишется, если в начальной форме перед «ня» стоит согласный звук. Например: песня  — песен, сотня  — сотен. Если же перед «ня» есть гласный, Ь появляется: дыня  — дынь, графиня  — графинь. Есть и исключения из правила, но слово «башня» к ним не относится.
Запишем правильно образованную форму в предложение.

Московский Кремль имеет двадцать башен.

Ответ: башен.